1、土壤质量的物理方针
土壤物理状况对植物生长和环境质量有直接或间接的影响。土壤物理方针包括土壤质地及粒径分布、土层厚度与根系深度、土壤容重和紧实度、孔隙度及孔隙分布、土壤结构、土壤含水量、田间持水量、土壤持水特征、浸透率和导水率、土壤排水性、土壤通气、土壤温度、妨碍层次深度、土壤侵蚀状况、氧扩散率、土壤耕性等。
2、土壤质量的化学方针
土壤中各种营养和土壤污染物质等的存在形状和浓度，直接影响植物生长和动物及人类健康。土壤质量的化学方针包括土壤有机碳和全氮、矿化氮、磷和钾的全量和有用量、CEC、土壤pH、电导率（全盐量）、盐基饱和度、碱化度、各种污染物存在形状和浓度等。
3、土壤质量的生物学方针
土壤生物是土壤中具有生命力的首要部分，是各种生物体的总称，包括土壤微生物、土壤动物和植物，是点评土壤质量和健康状况的重要方针之一。土壤中许多生物可以增进土壤质量状况，也有一些生物如线虫、病原菌等会下降土壤质量。目前应用较多的方针是土壤微生物方针，而中型和大型土壤动物方针正在研讨阶段。
土壤质量的生物学方针包括微生物生物量碳和氮，潜在可矿化氮、总生物量、土壤呼吸量、微生物品种与数量、生物量碳/有机总碳、呼吸量/生物量、酶活性、微生物群落指纹、根系分泌物、作物残茬、根结线虫等。
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